Olá João VIctor.
O ideal é que o sistema seja parametrizado para excluir essa parcela da produção ao calcular a distribuição dos custos para os demais setores.
Além disso, o custo referente ao autoconsumo deve ser tratado como absorção direta, permanecendo dentro do próprio centro de custo do restaurante, sem ser redistribuído. Isso evita que o setor acabe absorvendo parte de seu próprio custo, o que geraria distorções na apuração.
Para que essa lógica seja aplicada corretamente, é recomendável ajustar o sistema de apuração de custos para que ele:
—Reconheça a produção própria como não rateável;
—Considere apenas a produção destinada a outros setores como base de rateio;
—Mantenha o custo do autoconsumo como custo final do centro auxiliar, sem redistribuição.
Espero ter ajudado