Olá Elaine, tudo bem?
O correto é classificar conforme a posição da empresa na operação. Se ela emprestou dinheiro, registra no Ativo como “Créditos de Mútuo” (circulante ou não circulante, conforme o prazo). Se recebeu o empréstimo, registra no Passivo como “Obrigações de Mútuo”. E concordo com você, nas contas analíticas vale identificar cada empresa envolvida, criando a conta com o nome de cada uma.
Essa é a forma adequada para que o Balanço fique correto, em conformidade com o art. 179 da Lei 6.404/76 e o CPC 26, que tratam da classificação de ativos e passivos, além do CPC 05, que exige a identificação de operações entre partes relacionadas.
Espero ter ajudado!