Olá Isabela, tudo bem?
Sim, quando existem trabalhadores na obra, as informações enviadas corretamente no eSocial e vinculadas ao CNO dentro da DCTFWeb realmente geram abatimento no valor da aferição. Isso acontece porque as remunerações informadas reduzem o RMT (Remuneração da Mão de Obra Total) utilizado no cálculo da contribuição da obra.
O pagamento do INSS, por si só, não gera crédito adicional.
O que reduz o valor da aferição é apenas a informação correta da mão de obra declarada e vinculada.
O pagamento serve apenas para quitar o débito já apurado.
Espero ter ajudado.