Olá George
Entendo sua preocupação e situação.
Se no momento da intimação ou até mesmo após dentro do prazo de 30 dias você regularizou as pendências da empresa, seja pagando a vista ou parcelado, o termo é excluído automaticamente, pois foi respondido a intimação através da regularização da empresa.
No seu caso, recomendo que verifique o relatório fiscal para saber se ficou qualquer dívida ou pendência em aberto, regularize e aguarde Janeiro.
Como mencionei, se foi feito dentro do prazo a intimação é desconsiderada. Mas nada te impede também de entrar com a impugnação se essa intimação foi enviada sem motivos, sendo que a empresa estava em dias.
Espero ter ajudado.